随着我国经济的快速发展，企业数量和规模不断扩大，税务审计作为企业合规经营的重要环节，越来越受到重视。上海作为我国的经济中心，拥有众多大型企业和外资企业，其税务审计程序也相对完善。本文将详细介绍上海公司税务审计的主要程序，以帮助读者了解和掌握相关知识和技能。<

一、审计准备阶段

1. 审计计划制定

在审计准备阶段，审计人员需要根据审计目的和范围制定详细的审计计划。这包括确定审计时间、审计人员、审计方法等。审计计划应充分考虑企业的实际情况，确保审计工作的顺利进行。

2. 审计人员培训

为确保审计质量，审计人员需接受专业培训。培训内容包括税务法律法规、审计程序、审计技巧等。通过培训，审计人员能够提高自身业务水平，为后续审计工作奠定基础。

3. 审计资料收集

审计人员需收集与企业税务相关的资料，如财务报表、税务申报表、合同、发票等。收集资料时应注意资料的真实性、完整性和合法性。

二、现场审计阶段

1. 审计现场布置

审计人员到达审计现场后，需对审计环境进行布置，确保审计工作的顺利进行。布置内容包括审计人员办公场所、审计资料存放等。

2. 审计程序实施

审计人员按照审计计划，对企业的财务报表、税务申报表、合同、发票等资料进行审查。审查过程中，审计人员需关注企业是否存在偷税、漏税、骗税等违法行为。

3. 审计证据收集

审计人员需收集充分、可靠的审计证据，以支持审计结论。证据收集方式包括询问、观察、检查、函证等。

三、审计报告阶段

1. 审计结论形成

审计人员根据审计证据，对企业的税务合规性进行评价，形成审计结论。审计结论应客观、公正、准确。

2. 审计报告撰写

审计人员需撰写审计报告，详细阐述审计过程、审计结论和建议。审计报告应结构清晰、内容完整、语言规范。

3. 审计报告审核

审计报告完成后，需经过审计机构审核。审核内容包括审计程序、审计结论、审计报告质量等。

四、后续跟踪阶段

1. 审计问题整改

审计机构根据审计报告，要求企业对存在的问题进行整改。企业需按照要求，制定整改方案，并及时整改。

2. 整改效果评估

审计机构对企业的整改效果进行评估，确保问题得到有效解决。

3. 审计档案管理

审计机构对审计档案进行管理，包括审计资料、审计报告、整改材料等。

上海公司税务审计程序主要包括审计准备阶段、现场审计阶段、审计报告阶段和后续跟踪阶段。通过以上程序的执行，确保了企业税务合规性，维护了国家税收秩序。在今后的工作中，审计机构和企业应共同努力，提高税务审计质量，为我国经济发展贡献力量。

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